پس از قتل امیرکبیر، میرزا آقاخان نوری سرسپرده انگلیسی به صدارت رسید و بی کفایتی او در اداره مملکت سبب شد تا اوضاع نابسامان و آشفتهٔ قبل از امیرکبیر بر این مرز و بوم سایه بگستراند و هرات از ایران جدا شود و به دست انگلیسی ها بیفتد.
در زمان ناصرالدین شاه علاوه بر افغانستان، بسیاری از سرزمین های ایران واقع در شمال خراسان شامل مرو، خوارزم و خیوه توسط روس ها به یغما رفت و در همان حال انگلستان نیز قسمتهایی از سیستان و بلوچستان را از ایران جداساخت.